Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms