Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms