Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms