Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP47Q96K76 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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