Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms