Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4CQ96DT6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms