Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms