Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 HEXDC-210ENST00000582131 942 ntTSL 524.34■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PXK-207ENST00000468776 1653 ntTSL 1 (best)24.05■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 URI1-206ENST00000574110 2495 ntTSL 1 (best)24.03■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ERBB2-209ENST00000578709 559 ntTSL 423.39■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 WASF1-210ENST00000447287 652 ntTSL 323.26■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 URI1-209ENST00000574666 844 ntTSL 523.19■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 VPS37B-203ENST00000535765 879 ntTSL 322.99■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LIMK2-206ENST00000462625 1042 ntTSL 222.76■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HEXDC-212ENST00000582429 1824 ntTSL 222.47■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 522.4■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 422.29■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TBC1D20-203ENST00000461304 2024 ntTSL 1 (best)22.29■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AFG3L1P-207ENST00000423742 1012 ntTSL 322.23■■□□□ 1.151e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LARP4B-205ENST00000448368 1438 ntTSL 422.06■■□□□ 1.124e-8■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 321.88■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 221.67■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 IL17RC-213ENST00000451231 2163 ntTSL 221.53■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.026e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HLA-E-203ENST00000493699 907 nt21.36■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 521.35■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 221.27■■□□□ 11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 PRKRA-202ENST00000424699 1616 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KANSL1-214ENST00000576739 592 ntTSL 221.03■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 EML3-211ENST00000483199 1042 ntTSL 320.89■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM230-209ENST00000492419 1730 ntTSL 319.76■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ELL2-206ENST00000513343 582 ntTSL 319.75■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)19.66■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 319.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 519.49■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 31.4
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TBRG4Q969Z0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL17RC-209ENST00000436503 1445 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 319.32■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZNF580-205ENST00000592461 377 ntTSL 319.3■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HERC2-210ENST00000568206 2018 ntTSL 219.27■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL17RC-227ENST00000494365 2499 ntTSL 219.16■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 519.14■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PAWR-208ENST00000550006 493 ntTSL 318.93■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SARAF-202ENST00000517569 487 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.611e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 518.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 APBB2-218ENST00000509475 1486 ntTSL 218.83■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 31.4
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