Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms