Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms