Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms