Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms