Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMER3Q8N944 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMER3Q8N944 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms