Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms