Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTBP4Q8N2S1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms