Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms