Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms