Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLNKQ7Z7G1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms