Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT28Q7Z3Y7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms