Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13LQ71F56 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms