Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms