Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms