Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms