Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf89Q6UX73 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms