Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q6P435 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q6P435 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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