Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM53Q6P2H8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms