Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms