Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HES3Q5TGS1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms