Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms