Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms