Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms