Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
WDR44Q5JSH3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
WDR44Q5JSH3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms