Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF628Q5EBL2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms