Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms