Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms