Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms