Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NBPF1Q3BBV0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms