Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RTL8BQ17RB0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RTL8BQ17RB0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RTL8BQ17RB0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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