Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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CDO1Q16878 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CDO1Q16878 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CDO1Q16878 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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