Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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