Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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