Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FXNQ16595 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FXNQ16595 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FXNQ16595 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FXNQ16595 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FXNQ16595 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FXNQ16595 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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