Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms