Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC6Q16204 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms