Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIP4Q15650 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP4Q15650 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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