Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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