Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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CYTH1Q15438 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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