Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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