Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TNIP1Q15025 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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