Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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